La Escuela de Postgrado de la Universidad Nacional de la Amazonía Peruana (UNAP) fue creada mediante Resolución Rectoral 1081-87-UNAP, el 2 de julio de 1987. Este año 2023 cumple 36 años de creación al servicio de la educación superior en la región, el Perú y la Amazonía continental. Su creación se hace realidad como respuesta a los requerimientos de docentes universitarios capacitados, profesionales especializados e investigadores del más alto nivel para desenvolverse con eficiencia y eficacia en las instituciones públicas y privadas, y contribuir al desarrollo de la región y el país.

Tiene como misión ser una institución de excelencia académica, científica y tecnológica, líder en la formación de especialistas, maestros y doctores, y en la generación de conocimientos que contribuyen al desarrollo integral y sostenible de la Amazonía, integrada al mundo. Lleva el nombre del exrector José Torres Vásquez, y responde a las alternativas sociales e institucionales. Se encuentra al servicio del estudiante con una moderna y bien implementada infraestructura, con aulas, auditorio, biblioteca, centro de cómputo, entre otros servicios académicos.

Ha sido conducida por los siguientes profesionales: Prof. Felizardo Estela Campos, Mag., primer presidente de la Comisión, encargado con Resolución Rectoral del 15 de agosto de 1986; Lic. Julia Vásquez Villalobos, Mag., presidenta de la Comisión, encargada con Resolución Rectoral del 25 de septiembre de 1992; Lic. Adm. Jorge Pérez Santillán, presidente de la Comisión, encargado con Resolución del 24 de febrero de 1994; Ing. Juan I. Urrelo Correa, M. Sc., presidente de la Comisión, encargado con Resolución Rectoral del 2 de marzo de 1994, y por acuerdo del Consejo Universitario fue elegido como primer director, con Resolución Rectoral del 4 de julio de 1995, siendo luego reelegido para un segundo periodo con Resolución Rectoral del 5 de enero de 1999; Blgo. Lorgio Verdi Olivares, Dr., director nombrado con Resolución Rectoral del 1 de enero de 2002; Lic. Julia Vásquez Villalobos, Mag., directora encargada con Resolución Rectoral del 5 de mayo de 2005; Econ. Carlos Hernán Zumaeta Vásquez, Dr., director nombrado con Resolución Rectoral del 5 de diciembre de 2007; Ing. Victoria Reátegui Quispe, Dra., directora nombrada con Resolución Rectoral del 1 de febrero del 2009; Lic. Enf. Zulema Sevillano Bartra, Dra., directora encargada con Resolución Rectoral del 1 de febrero de 2012; Ing. Victoria Reátegui Quispe, Dra., directora encargada con Resolución Directoral 1415-12-UNAP; Lic. Enf. Matilde Rojas García, Dra., nombrada con Resolución Rectoral del 4 de diciembre de 2015.

Actualmente tiene como director, al doctor Carlos Hernán Zumaeta Vásquez, docente principal nombrado a dedicación exclusiva del Departamento Académico de Economía de la Facultad de Ciencias Económicas y de Negocios (Facen) de la UNAP. Bachiller en Economía y economista; magíster en Docencia Universitaria, doctor en Medio Ambiente y Desarrollo Sostenible y doctor en Ciencias Empresariales.

Este año 2023, la Escuela de Postgrado de la UNAP cuenta con 38 maestrías y 10 doctorados.