La Facultad de Ciencias Económicas y de Negocios, como parte integrante de la Universidad Nacional de la Amazonía Peruana a través de sus cuatro escuelas profesionales: Administración, Contabilidad, Economía y de Negocios Internacionales y Turismo, cada una con sus respectivos departamentos académicos, forma profesionales que hacen que esta región se desarrolle acorde con la globalización.
Inició sus actividades académicas con la Escuela Profesional de Administración el año 1974, aprobándose su creación por parte del Consejo Nacional de la Universidad Peruana, mediante Resolución 2228 del 28 de abril de 1975.
La Escuela Profesional de Contabilidad inició sus actividades el año 1978, aprobándose su creación mediante Resolución 4775-CONUP-77 del Consejo Nacional de la Universidad Peruana.
La Escuela Profesional de Economía inició sus actividades el año 1989, aprobándose su creación mediante Resolución Rectoral 0211-89-UNAP.
La Escuela Profesional de Negocios Internacionales y Turismo inició sus actividades el año 1999, aprobándose su creación mediante Resolución Rectoral 1176-98-UNAP.
Desde sus inicios, la Facultad de Ciencias Económicas y de Negocios, ha buscado destacar y liderar los cambios en la Universidad, este anhelo le ha llevado a tener hoy una plana docente de profesionales de primer nivel, la mayoría de ellos con estudios de postgrado y personal administrativo calificado que se encuentra en proceso de mejoramiento continuo. Además, posee una moderna infraestructura muy bien equipada, cuyas oficinas administrativas cuentan con internet durante las 24 horas.